標榜科を20程度まで削減することを検討してきた厚生労働省は、医師会・学会等の強い反対を受け、大幅な拡大へと方針転換した。今ある診療科はほぼ残り、内科や外科と体の部位などを組み合わせて標榜できるようにする。

グラクソ・スミスクライン社（東京都渋谷区）と大正製薬（東京都豊島区）は大衆薬では国内初となるヘルペス薬を10月９日に発売する。

９月２７日、厚生労働省は医道審議会の答申を受け、刑事事件で有罪が確定した者など、医師５８人、歯科医師１９人の計７７人の行政処分を発表した。これは過去最多となる。

　9月18日に東京都が不適正処方の疑いで新宿区のクリニックを医療法に基づき、立ち入り検査をしてマスコミ報道で話題となった向精神薬「リタリン」（一般名：塩酸メチルフェニデート）について、製造販売元のノバルティスファーマ社（東京都港区）は、適応症から難治性・遷延性うつ病を除外する方針を固めた。リタリンは1958年にうつ病治療薬として販売され、現在は「難治性うつ病」「遷延性うつ病」、日中突然眠くなる睡眠障害「ナルコレプシー」の効能が承認されている。